一體式視頻顯微鏡因其所具備的眾多優點在各個行業有著廣泛的應用。若在使用過程中出現一些問題可根據實際情況自行解決。根據實際使用情況常見的故障有：視場較模糊或有臟物，也許的原因有標本上有臟物，目鏡表層有臟物，物鏡表層有臟物，工作板表層有臟物。可根據實際情況采取清潔標本，目鏡，物鏡和工作板表層的臟物解決。
　　雙像不重合也許的原因為瞳距微調不正確可采取修正瞳距的措施，雙像不重合也也許是視度微調不正確可采取重新進行視度微調，還有也許是左右目鏡倍率不同可檢查目鏡并重新安裝相同倍率的目鏡。如果是圖像不清晰也許是物鏡表層有臟物請清潔物鏡。如果變焦時圖像不清晰有也許是視度調整不正確和調焦不正確，可重新進行視度微調和調焦。一體式視頻顯微鏡若發生燈泡經常燒掉和燈光閃爍不定的情況時，則也許是當地的線電壓太高，燈泡快燒壞了和電線連接不良，請仔細檢查電壓和顯微鏡的電線連接情況是否牢固，如不是則也許是燈泡快燒壞了可重新更換燈泡解決。
　　一體式視頻顯微鏡在使用前的調校主要有：調焦，視度調節，瞳距調節和燈泡更換幾個步驟。下面分別進行說明。調焦：將工作臺板放入底座上的臺板安裝孔內。觀察透明標本時，選用毛玻璃臺板； 觀察不透明標本時，選用黑白臺板。然后松開調焦滑座上的緊固螺釘，調節鏡體的高度，使其與所選用的物鏡放大倍數大體一致的工作距離。調好后，須鎖緊緊固螺釘。調焦時，建議選用平面物體，如印有字符的平整紙張、直尺、三角板等。視度調節：先將左右目鏡筒上的視度圈均調至0刻線位置。